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PCR擴(kuò)增曲線(xiàn)異常——斜直線(xiàn)型擴(kuò)增曲線(xiàn)

更新時(shí)間:2024-07-18  |  點(diǎn)擊率:666

現(xiàn)象描述:

在進(jìn)行PCR擴(kuò)增時(shí),發(fā)現(xiàn)部分樣本的擴(kuò)增曲線(xiàn)呈現(xiàn)斜直線(xiàn)型,而非正常的平滑S型曲線(xiàn)。這種異常曲線(xiàn)表明PCR反應(yīng)可能存在問(wèn)題,導(dǎo)致擴(kuò)增效率不穩(wěn)定或擴(kuò)增產(chǎn)物非特異性。

 

原因分析:

管蓋未蓋緊:由于每天處理的標(biāo)本量較大,操作人員在加樣后可能未將PCR管蓋緊,導(dǎo)致在擴(kuò)增過(guò)程中反應(yīng)液蒸發(fā),管內(nèi)體積減少。這不僅改變了讀取熒光的標(biāo)準(zhǔn),還可能導(dǎo)致探針濃度增加,進(jìn)而形成斜直線(xiàn)型擴(kuò)增曲線(xiàn)。

耗材問(wèn)題:使用的PCR反應(yīng)管或封膜質(zhì)量不佳,也可能導(dǎo)致反應(yīng)液蒸發(fā)或熒光信號(hào)采集異常。例如,反應(yīng)管氣密性差、封膜不牢固等。

實(shí)驗(yàn)操作不規(guī)范:如加樣時(shí)產(chǎn)生大量氣泡,氣泡在PCR過(guò)程中破裂會(huì)影響熒光信號(hào)的穩(wěn)定采集,導(dǎo)致擴(kuò)增曲線(xiàn)異常。

 

解決方案:

嚴(yán)格操作規(guī)范:在進(jìn)行PCR加樣時(shí),務(wù)必確保PCR管蓋緊,并使用質(zhì)量合格、匹配度高的耗材。同時(shí),加樣時(shí)要避免產(chǎn)生大氣泡,上機(jī)前注意彈掉氣泡并離心。

檢查耗材質(zhì)量:定期評(píng)估耗材的質(zhì)量,選擇品牌好、質(zhì)量可靠的PCR反應(yīng)管和封膜。如果發(fā)現(xiàn)耗材有問(wèn)題,應(yīng)及時(shí)更換。

復(fù)查樣本:對(duì)于出現(xiàn)斜直線(xiàn)型擴(kuò)增曲線(xiàn)的樣本,建議進(jìn)行復(fù)查。可以重新提取核酸并重新進(jìn)行PCR擴(kuò)增,以排除實(shí)驗(yàn)操作過(guò)程中的偶然因素。

優(yōu)化PCR條件:如果問(wèn)題持續(xù)存在,可能需要調(diào)整PCR反應(yīng)條件,如退火溫度、循環(huán)次數(shù)等。通過(guò)梯度PCR等方法找到最佳的擴(kuò)增條件。

 

通過(guò)這個(gè)實(shí)際案例可以看出,PCR結(jié)果不滿(mǎn)意的原因往往與實(shí)驗(yàn)操作、耗材質(zhì)量、PCR條件等多方面因素有關(guān)。只有全面分析問(wèn)題、找出原因并采取有效的解決方案,才能提高PCR的成功率和準(zhǔn)確性。使用德國(guó)MB公司生產(chǎn)的PCR Clean核酸污染清除試劑,維護(hù)實(shí)驗(yàn)室衛(wèi)生,可以幫助分子實(shí)驗(yàn)達(dá)到更高的準(zhǔn)確度。


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